修學佛法主要目的為出離生死得寂滅，這是從原始到大乘佛教之共同目標。可是為此目的，有效手段必不可缺，以斷除煩惱為終極目標獲得寂滅，並需要建立一套完善可行的修行系統作為依據。我希望在此簡介唯識系中煩惱學說的一些特色。
佛教徒一定可舉出一些很具體的煩惱，如貪、瞋、痴三毒等。可是，煩惱在我們的生命裏面又擔當著甚麼角色呢？
世親菩薩早於《俱舍論》已指出業由煩惱所推動才可以生長，如果沒有煩惱，業沒有能力招感後來的生命果報。[1]這即是就染污的角度出發，所以消滅煩惱是證得寂滅的一個必要條件。[2]
唯識系的煩惱學說可說是承繼兩大部派，經量部及說一切有部，綜合並抉擇兩部。
就煩惱的定義而言，唯識系與經量部相似，把煩惱分為存在於覺位（已經生起）及睡位（潛伏）。[3]已經生起的煩惱已有其作用並纏繞著我們的心，令心不得安寧不得自在；而睡位的煩惱就是未生起的煩惱種子[4]，而唯識系更形象化，並建立阿賴耶識以儲存這些種子，作為種子及業力的載體。當這些種子遇上合適的條件便會生起，如見到喜歡的事物會生起貪等這些情況。
就煩惱的系統及修行的階段，唯識系吸納說一切有部的煩惱架構。兩者都以貪、瞋、痴、慢、疑、惡見六種煩惱為根本，這可以從《唯識三十頌》的第十二頌看到所列舉的六種根本煩惱。後再將惡見具體化，分為身見、邊見、邪見、見取見、戒禁取見五種而成為十種根本煩惱，而且是與心識相應的心所有法（心理活動狀態）。
而對於這些煩惱的分類，又分為見道時斷除及修道時斷除，如配合唯識系的修行，即是見道位及修道位。見道時，修行者直接證悟苦、集、滅、道四諦，破除及消滅對四諦真理不明了的煩惱，所以見道斷分為四個項目加上修道斷，共五項，再配合十種根本煩惱及三界，而成為一百二十八種煩惱[5]，這有別於說一切有部的九十八種[6]。我以為主要原因是唯識系以大乘角度出發，配合唯識的修道位，在修道的十地的菩薩階段時，再須斷除先天及後天的煩惱（我執、法執），所以修道斷的煩惱定比有部多。
說起先天（俱生）及後天（分別）的煩惱，唯識系是很具應用性的。俱生是指本來就存在，不需要透過後天的教育及學習，例如嬰兒的生存意欲；而分別煩惱是透過後天的學習，例如相信有一個實在不變的靈魂等。
除了根本煩惱之外，還有二十種隨煩惱[7]，隨煩惱跟隨著根本煩惱而生起，屬於次要的煩惱，而出現的狀況每每不同，屬於個別的性質，例如無慚是對應該尊敬的賢哲不尊重，無愧是對世間的呵責不懼怕。其實要說隨煩惱的種類可以分為更多[8]，不過以唯識系的歸納為二十種，這個數量是一定較容易理解及修行上會遇到的心理狀況。
事實上要論及整個煩惱系統是相當龐大的，特別是部派佛教中不同阿毗達磨論書對煩惱的理解，可以有很大距離的差別[9]，而討論可以涉及整個修行、因緣、業力等等的架構理論。雖然這些理論聽起來未免充滿經院哲學的味道，不過我希望指出的是，在這個龐大架構背後的精神及意義。首先，它提供一個具體而又可認證的修行藍圖，並且系統化，令修行者可銘記在心中，再配合修定、修慧，以拔除一切煩惱，達到寂滅，故重視煩惱並非消極，而是積極面對自身的不足及對治煩惱；此外，對於修行及體證真理，這藍圖並未曾離開佛陀於原始佛教的教法，以於見道時需要體證四諦，不離開四諦以斷除煩惱；所以唯識系絕對重視修行，並透過它的認知論、業論、定學等，達到出世及教化有情的淑世精神。
[1] 《俱舍論》卷九：「業由隨眠方得生長；離隨眠，業無感有能。」《俱舍論》以隨眠說，在說一切有部的立場隨眠與煩惱為同義詞。世親是宗經部，認為隨眠是煩惱的種子。總之，不論從哪方面看，隨眠煩惱是推動下期生命的主要動力。
[2] Cf.《阿毘達磨順正理論》卷四十五；Buescher, Hartmut. The Triṃśikāvijñaptibhāṣya of Sthiramati: Critical Editions of the Sanskrit Text and Its Tibetan Translation. Department of Asian Studies, University of Copenhagen, 2002, p.118.
[3]《俱舍論》卷十九：「何名為睡？謂：不現行，種子隨逐。何名為覺？謂：諸煩惱現起纏心。」《瑜伽師地論》卷十三：「云何現行？謂諸煩惱纏。云何睡眠？謂：諸煩惱隨眠。」
[4] Cf. Jaini, Padmanabh S. “The Sautrantika Theory of Bija.” Bulletin of the School of Oriental and African Studies 22.2 (1959): pp.236-249.
[5]《瑜伽師地論》卷八：「或分一百二十八煩惱」；加藤純章：〈随眠──anuśaya〉，《仏教学 28》 (1990): pp.1-32.
[6] Cf. 櫻部建：〈九十八隨眠說の成立について〉，《大谷学報（The Otani Gakuho 35.3）》 (1955): pp.20-30.
[7] 《唯識三十頌》：「隨煩惱謂忿、恨、覆、惱、嫉、慳、誑、諂、與害、憍；無慚，及無愧；掉舉與惛沈、不信並懈怠、放逸及失念、散亂、不正知。」
[8] 隨煩惱的定義十分之廣泛，如《品類足論》卷一：「隨煩惱云何？謂諸隨眠，亦名隨煩惱，有隨煩惱不名隨眠，謂除隨眠諸餘染污行蘊心所。」又如《法蘊足論》卷九〈雜事品第十六〉列舉七十八種所應斷的法。
[9] Cf. Kato, Hiromichi:〈隨眠のはたらき〉》，《佛教學研究 38》(1982): pp.28-58.
